シカジーニアス®分子疫学解析POTキット(黄色ブドウ球菌用)

メチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA)は医療関連感染の主な原因菌であり、この蔓延防止には菌体
間の相同性などを解析し、適切な拡散予防策を講じる必要があります。
藤田医科大学の鈴木匡弘先生により開発されたPCR-based ORF Typing(POT法)は、マルチプ
レックスPCRを用いて複数の特定遺伝子を同時に増幅し、アガロース電気泳動で検出された増幅バン
ドパターンを解析し、菌体間の相同性を比較する方法です。
特長
●約4時間で分子疫学解析が可能
●パルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)と異なり、汎用的な機器で測定可能
●解析結果を数値化(POT値)にすることで、菌体間の相同性を比較可能
キット構成
個別名称 | 容量 | 数量 | |
---|---|---|---|
試薬A | AptaTaq DNA Master(5×Conc.)* | 1.0 mL | 1 本 |
試薬B | PCRサプリメント | 1.0 mL | 1 本 |
試薬C | プライマーミックスα | 0.5 mL | 1 本 |
試薬D | プライマーミックスβ | 0.5 mL | 1 本 |
試薬E | ポジティブコントロール | 1.0 mL | 1 本 |
試薬F | 6×ローディングバッファー(BPB・XC) | 1.0 mL | 1 本 |
*AptaTaq DNA Master(5×Conc.)は、Roche Diagnostics K.K.の商品です。
操作手順
① | 黄色ブドウ球菌を単離する(培養) |
---|---|
② | DNA抽出を行い、テンプレートDNAを調製 |
③ | 2種類のマルチプレックスPCR |
④ | アガロースゲル電気泳動 |
⑤ | バンドパターンの読み取り |
⑥ | POT値の算出 |
⑦ | 各検体でのPOT値の比較解析 |
解析方法

電気泳動のパターン
50 : 50 bp DNAラダー
P:ポジティブコントロール
1:ATCC® 700699(MRSA Mu50)
2:ATCC® BAA-1556(MRSA USA300)
3:ATCC® 43300(MRSA)
4:ATCC® 25923(MSSA)
5:ATCC® 29213(MSSA)
6,7:集団感染事例1から得られた臨床分離株
8,9:集団感染事例2から得られた臨床分離株
藤田医科大学 鈴木匡弘先生のご厚意により、電気泳動パターンの実例データをご提供頂きました。
検出ORFの種類(ターゲット領域)とそのPCR増幅産物サイズ
POT No. | 増幅サイズ(bp) | ターゲット領域 | |
---|---|---|---|
Reaction mixture 1 |
femA | 601 | S. aureus positive control |
POT 1-1 | 530 | mecA | |
POT 1-2 | 449 | mec gene complex class B | |
POT 1-3 | 355 | SCCmec type Ⅱa specific | |
POT 2-1 | 304 | Tn554 | |
POT 2-2 | 271 | プロファージ | |
POT 2-3 | 228 | プロファージ | |
POT 2-4 | 197 | プロファージ | |
POT 2-5 | 161 | プロファージ | |
POT 2-6 | 131 | プロファージ | |
POT 2-7 | 106 | プロファージ | |
POT 2-8 | 81 | Genomic Island | |
Reaction mixture 2 |
femA | 601 | S. aureus positive control |
POT 1-4 | 477 | cassette chromosome recombinase A2 | |
POT 1-5 | 388 | 遺伝的バックグラウンド | |
POT 1-6 | 320 | 遺伝的バックグラウンド | |
POT 1-7 | 273 | mec gene complex class A | |
POT 3-1 | 243 | プロファージ | |
POT 3-2 | 197 | プロファージ | |
POT 3-3 | 171 | プロファージ | |
POT 3-4 | 140 | プロファージ | |
POT 3-5 | 115 | プロファージ | |
POT 3-6 | 95 | プロファージ | |
POT 3-7 | 78 | プロファージ |
①2つのマルチプレックスPCRの電気泳動結果からバンドパターンを読み取ります。
②この電気泳動のバンドの有無の結果を用いて、POT値解析用エクセルシートに二進法で入力し、3つのカテゴリーのPOT値を算出します。
ⅰ)femAが陽性の場合、その検体は黄色ブドウ球菌であることが確認できます。
また、MRSAの場合、POT 1の値の合計は64以上になります。
ⅱ)検体間のPOT値を比較することで、菌体間の相同性を客観的に推測できます。
ⅲ)集団感染から得られた菌体は、POT 1~3のPOT値が全て同一になります。
カテゴリー | サンプル番号 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |
POT 1 | 93 | 106 | 95 | 6 | 4 | 93 | 93 | 73 | 73 |
POT 2 | 255 | 77 | 136 | 16 | 58 | 190 | 190 | 156 | 156 |
POT 3 | 96 | 113 | 66 | 35 | 112 | 103 | 103 | 120 | 120 |
製品一覧
製品番号 | 製品名 | 保存温度 | 規格 | 包装 | 価格 |
---|---|---|---|---|---|
08178-96 | シカジーニアスR DNA抽出試薬 Cica geneusR DNA extraction reagent |
冷蔵 | 分子生物学用 | 1pack(120回分) | ¥22,000 |
08180-96 | シカジーニアスR 分子疫学解析POTキット(黄色ブドウ球菌用) Cica geneusR staph POT kit |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(120回分) | ¥83,000 |
08180-97 | シカジーニアスR 分子疫学解析POTキット(黄色ブドウ球菌用) Cica geneusR staph POT kit |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(30回分) | ¥38,000 |
・「法律」,「SDS」,「在庫」など詳細情報は、製品番号をクリックいただきご確認いただけます。
・試薬のご購入とご使用に際して
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製品番号 | 製品名 | 保存温度 | 規格 | 包装 | 価格 |
---|---|---|---|---|---|
08062-96 | シカジーニアスR 分子疫学解析POTキット(アシネトバクター属菌用) Cica geneusR Acineto POT KIT |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(30回分) | ¥42,000 |
08143-96 | シカジーニアスR AmpC遺伝子型検出キット Cica geneusR AmpC Genotype detection kit |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(30回分) | ¥38,000 |
08158-96 | シカジーニアスR カルバペネマーゼ遺伝子型検出キット2 Cica geneusR Carbapenemase Genotype detection kit 2 |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(30回分) | ¥42,000 |
08362-97 | シカジーニアスR 分子疫学解析POTキット(大腸菌用) Cica geneusR E.coli POT kit |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(30回分) | ¥42,000 |
08116-96 | シカジーニアスR ESBL遺伝子型検出キット2 Cica geneusR ESBL Genotype Detection KIT2 |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(30回分) | ¥42,000 |
08087-96 | シカジーニアスR 病原遺伝子検出PCRキット(下痢原性大腸菌用) Cica geneusR Pathogenesis Gene Detection PCR Kit (for Diarrheagenic E.coli) |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(100回分) | ¥85,000 |
08187-96 | シカジーニアスR 分子疫学解析POTキット(緑膿菌用) Cica geneusR Pseudo POT kit |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(50回分) | ¥64,000 |
08179-96 | シカジーニアスR コアグラーゼ検出セット Cica geneusR staph coaglase detection set |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(50回分) | ¥50,000 |
08180-96 | シカジーニアスR 分子疫学解析POTキット(黄色ブドウ球菌用) Cica geneusR staph POT kit |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(120回分) | ¥83,000 |
08180-97 | シカジーニアスR 分子疫学解析POTキット(黄色ブドウ球菌用) Cica geneusR staph POT kit |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(30回分) | ¥38,000 |
08115-96 | シカジーニアスR毒素遺伝子検出キット(C. difficile用) Cica geneusR Toxin Gene Detection KIT (for C. difficile) |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(30回分) | ¥42,000 |
・「法律」,「SDS」,「在庫」など詳細情報は、製品番号をクリックいただきご確認いただけます。
・試薬のご購入とご使用に際して
分離培地
製品番号 | 製品名 | 保存温度 | 包装 | 価格 |
---|---|---|---|---|
72046 | クロモアガーMRSAスクリーン培地 CHROMagarTM MRSA medium (Prepared media) |
冷蔵 | 10枚 | ¥2,800 |
72075 | クロモアガーMRSA/スタッフアウレウス分画培地 CHROMagarTM MRSA/Staph aureus (Prepared media) |
冷蔵 | 10枚×2 | ¥6,000 |
・「法律」,「SDS」,「在庫」など詳細情報は、製品番号をクリックいただきご確認いただけます。
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パンフレット
シカジーニアス® 分子疫学解析キット(黄色ブドウ球菌用) (1,834KB)
取扱説明書
シカジーニアス®分子疫学解析POTキット(黄色ブドウ球菌用)(725KB)
計算シート(ZIPファイル、エクセル)
POT(Staph)計算シート(ZIPファイル、730KB)
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