シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(大腸菌用)

大腸菌(E. coli)は、自然環境中に広く存在する日和見感染菌です。医療環境においては、食中毒や
院内感染といった集団感染の原因になることが多く、感染管理が重要となります。
本キットは、大腸菌の菌種同定、クローン同定および菌株識別を行うための遺伝子型別キットです。
PCR-based ORF Typing(POT)法では、マルチプレックスPCRを用い、大腸菌の保有する複数の特定遺伝子領域を増幅し、アガロースゲル電気泳動法によって分離されたバンドパターンを数
値化することで、クローン同定および菌株識別を遺伝学的に決定します。
特長
●解析結果を数値化(POT値)することで、E.coil の菌株識別が可能。
●約4時間以内で分子疫学解析が可能。
●特別な装置は不要。
●特にESBL産生大腸菌において、PFGEに近い識別能。
キット構成(30回)
個別名称 | 容量 | 数量 | |
---|---|---|---|
試薬A | AptaTaq DNA Master(5×Conc.)* | 240 μL | 1 本 |
試薬B | PCRサプリメント | 240 μL | 1 本 |
試薬C | プライマーミックスα | 120 μL | 1 本 |
試薬D | プライマーミックスβ | 120 μL | 1 本 |
試薬E | ポジティブコントロール | 240 μL | 1 本 |
試薬F | 6×ローディングバッファー(BPB・XC) | 240 μL | 1 本 |
*AptaTaq DNA Master(5×Conc.)は、Roche Diagnostics K.K.の商品です。
操作手順
① | 分離した菌株を純培養 |
---|---|
② | DNA抽出を行い、テンプレートDNAを調製 |
③ | 2種類のマルチプレックスPCR |
④ | アガロースゲル電気泳動 |
⑤ | バンドパターンの読み取り |
⑥ | POT値の算出 |
⑦ | 各検体でのPOT値の比較解析 |
解析方法

電気泳動のパターン
M:50 bp DNAラダー
P:ポジティブコントロール
N:ネガティブコントロール(TE緩衝液)
1-4 : 大腸菌の分離株
検出ORFの種類(ターゲット領域)とそのPCR増幅産物サイズ
POT No. | 増幅サイズ(bp) | ターゲット領域 | |
---|---|---|---|
Reaction mixture 1 |
PCR PC | 652 | E.coil 判定領域 |
POT 1-1 | 511 | Genomic Islet-1 | |
POT 1-2 | 415 | Genomic Islet-2 | |
POT 1-3 | 363 | Genomic Islet-3 | |
POT 1-4 | 307 | Genomic Islet-4 | |
POT 1-5 | 253 | Genomic Islet-5 | |
POT 1-6 | 222 | Genomic Islet-6 | |
POT 2-1 | 178 | bla CTX-M-2 | |
POT 2-2 | 146 | Genomic Island-1 | |
POT 2-3 | 123 | Genomic Island-2 | |
POT 2-4 | 98 | Genomic Island-3 | |
POT 2-5 | 80 | Genomic Island-4 | |
Reaction mixture 2 |
PCR PC | 652 | E.coil 判定領域 |
POT 2-6 | 527 | Genomic Islet-7 | |
POT 2-7 | 436 | Genomic Island-5 | |
POT 2-8 | 361 | bla CTX-M-1 | |
POT 3-1 | 311 | Genomic Island-6 | |
POT 3-2 | 250 | Genomic Island-7 | |
POT 3-3 | 219 | Genomic Islet-8 | |
POT 3-4 | 179 | Genomic Island-8 | |
POT 3-5 | 154 | Genomic Island-9 | |
POT 3-6 | 122 | Genomic Islet-9 | |
POT 3-7 | 102 | Genomic Island-10 | |
POT 3-8 | 79 | bla CTX-M-9 |
①2つのマルチプレックスPCRの電気泳動結果からバンドパターンを読み取ります。
②この電気泳動のバンドの有無の結果を用いて、POT値解析用エクセルシートに二進法で入力し、3つのカテゴリーのPOT値を算出します。
ⅰ)PCR PCが陽性の場合、大腸菌(Escherichia coli )と判定します。
ⅱ)POT2の値が奇数であればCTX-M-1 group、128 以上であればCTX-M-2 group、
POT3の値が奇数であればCTX-M-9 group の各ESBL 遺伝子を保有しています。
ⅲ)検体間のPOT 値を比較することで、E. coli の菌体間の相同性を客観的に推測出来ます。
ⅳ) 集団感染から得られた菌体はPOT 1 ~ 3 のPOT 値が全て同一になります。
解析結果
カテゴリー | サンプル番号 | |||
---|---|---|---|---|
1 | 2 | 3 | 4 | |
POT 1 | 20 | 26 | 49 | 49 |
POT 2 | 1 | 144 | 58 | 101 |
POT 3 | 94 | 4 | 215 | 178 |
製品一覧
製品番号 | 製品名 | 保存温度 | 規格 | 包装 | 価格 |
---|---|---|---|---|---|
08178-96 | シカジーニアスR DNA抽出試薬 Cica geneusR DNA extraction reagent |
冷蔵 | 分子生物学用 | 1pack(120回分) | ¥22,000 |
08362-97 | シカジーニアスR 分子疫学解析POTキット(大腸菌用) Cica geneusR E.coli POT kit |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(30回分) | ¥42,000 |
★本キットは愛知県と中部大学から特許許諾を得て、製造販売しております。
★他メーカーの商品に関するライセンス・パテントについては、各メーカーにご確認ください。
★製品の仕様は、製品の改良のため変更する場合がございます。あらかじめご了承ください。
・「法律」,「SDS」,「在庫」など詳細情報は、製品番号をクリックいただきご確認いただけます。
・試薬のご購入とご使用に際して
関連製品
POTキット・PCRキット
製品番号 | 製品名 | 保存温度 | 規格 | 包装 | 価格 |
---|---|---|---|---|---|
08062-96 | シカジーニアスR 分子疫学解析POTキット(アシネトバクター属菌用) Cica geneusR Acineto POT KIT |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(30回分) | ¥42,000 |
08143-96 | シカジーニアスR AmpC遺伝子型検出キット Cica geneusR AmpC Genotype detection kit |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(30回分) | ¥38,000 |
08158-96 | シカジーニアスR カルバペネマーゼ遺伝子型検出キット2 Cica geneusR Carbapenemase Genotype detection kit 2 |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(30回分) | ¥42,000 |
08362-97 | シカジーニアスR 分子疫学解析POTキット(大腸菌用) Cica geneusR E.coli POT kit |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(30回分) | ¥42,000 |
08116-96 | シカジーニアスR ESBL遺伝子型検出キット2 Cica geneusR ESBL Genotype Detection KIT2 |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(30回分) | ¥42,000 |
08087-96 | シカジーニアスR 病原遺伝子検出PCRキット(下痢原性大腸菌用) Cica geneusR Pathogenesis Gene Detection PCR Kit (for Diarrheagenic E.coli) |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(100回分) | ¥85,000 |
08187-96 | シカジーニアスR 分子疫学解析POTキット(緑膿菌用) Cica geneusR Pseudo POT kit |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(50回分) | ¥64,000 |
08179-96 | シカジーニアスR コアグラーゼ検出セット Cica geneusR staph coaglase detection set |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(50回分) | ¥50,000 |
08180-96 | シカジーニアスR 分子疫学解析POTキット(黄色ブドウ球菌用) Cica geneusR staph POT kit |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(120回分) | ¥83,000 |
08180-97 | シカジーニアスR 分子疫学解析POTキット(黄色ブドウ球菌用) Cica geneusR staph POT kit |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(30回分) | ¥38,000 |
08115-96 | シカジーニアスR毒素遺伝子検出キット(C. difficile用) Cica geneusR Toxin Gene Detection KIT (for C. difficile) |
冷凍 | 分子生物学用 | 1pack(30回分) | ¥42,000 |
・「法律」,「SDS」,「在庫」など詳細情報は、製品番号をクリックいただきご確認いただけます。
・試薬のご購入とご使用に際して
分離培地
製品番号 | 製品名 | 保存温度 | 包装 | 価格 |
---|---|---|---|---|
72101 | クロモアガーESBL生培地 CHROMagarTM ESBL(prepared) |
冷蔵 | 10枚 | ¥3,100 |
72120 | クロモアガーオリエンタシオン/ESBL分画培地 CHROMagarTM Orientation/ESBL Agar |
冷蔵 | 10枚 | ¥2,800 |
・「法律」,「SDS」,「在庫」など詳細情報は、製品番号をクリックいただきご確認いただけます。
・試薬のご購入とご使用に際して
パンフレット
シカジーニアス® 分子疫学解析キット(大腸菌用) (1,695KB)
取扱説明書
シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(大腸菌用)(926KB)
計算シート(ZIPファイル、エクセル)
関連詳細ページ
シカジーニアス® POTキットシリーズ
シカジーニアス® 薬剤耐性菌・病原因子関連PCRキットシリーズ
シカジーニアス® DNA抽出試薬
シカジーニアス® 核酸精製キット
電気泳動槽
ゲル撮影装置・UVトランスイルミネーター
サーマルサイクラー ジーンアトラス
臨床検査薬に関する
お問い合わせ
メールでのお問い合わせ
お電話でのお問い合わせ